Гематологическое отделение развернуто на 25 коек и оказывает экстренную и плановую специализированную помощь детям города Алматы и других регионов РК с заболеваниями все виды анемий (железодефицитная, витамин В12 и фолиево-дефицитная анемии, гемолитические анемии), тромбоцитопении и тромбоцитопатии; наследственные и приобретенные коагулопатии; геморрагический васкулит.
Проводятся следующие виды обследования: наследственные и приобретенные коагулопатии; общеклинические и биохимические анализы крови; костномозговая пункция;коагулограмма; исследование агрегации и адгезии тромбоцитов; кривая Прайса-Джонса; электрофорез гемоглобина; исследование белковых фракций; определение осмотической резистентности эритроцитов; прямая и не прямая реакция Кумбса. Лечение проводится согласно протоколам диагностики и лечения утверждённым МЗ РК.